La fédération est membre du Comité National de la Biodiversité.
Créé par la loi n° 2016-1087 du 8 août 2016 relative à la reconquête de la biodiversité, de la nature et des paysages et installé le 23 mars 2017, le Comité national de la biodiversité (CNB) est l’instance d’information, d’échanges et de consultation sur les questions stratégiques liées à la biodiversité. Il peut être consulté par le gouvernement sur tout sujet relatif à la biodiversité ou ayant un effet notable sur celle-ci.
Il comprend quatre commissions spécialisées
n°1: Connaissance de la biodiversité, système d’information, diffusion et éducation.
n° 2: Stratégies nationales et engagements internationaux et européens de la France
n°3: Aires et espèces protégées.
n°4: Politiques de la biodiversité et territoires
la Fédération participe aux travaux de la commission n°1 Connaissance et diffusion.